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林羽在狱中凭借精湛医术接连治好患病囚犯，消息像风一样在监狱里传开，不光是囚犯，连狱卒们都对他另眼相看。曾经对他恶语相向、动辄打骂的狱卒，如今也会和颜悦色地询问他草药的需求，甚至主动帮他留意监狱外是否有合适的草药。林羽从一个被众人欺凌的阶下囚，摇身一变成为大家眼中的救命稻草。
林羽并未因此而骄傲自满，他清楚自己还身处困境，复仇之路更是漫长。每治愈一个人，他都详细记录下病症、治疗过程和效果，不断总结经验，将现代医学知识与《济世医典》中的古法相互印证，完善自己的医疗体系。他发现古代中医在情志治疗方面有着独特见解，便尝试开导那些因牢狱生活而意志消沉、病情难愈的囚犯，通过聊天、讲故事等方式舒缓他们的情绪，辅助药物治疗，往往能取得事半功倍的效果。
然而，林羽在狱中的一举一动都被暗中监视着。孙霸得知林羽不仅没死，还在狱中混得风生水起，心中又惊又怒。他担心林羽会找到机会翻案，于是再次找到刘贵，两人在密室中密谋。“刘捕头，这林羽留着始终是个祸患，必须想办法除掉他！”孙霸恶狠狠地说。刘贵皱了皱眉头，心中有些犹豫：“可现在他在狱中名声颇好，要是贸然动手，恐怕会引起其他囚犯不满，万一传到上面去……”孙霸不耐烦地打断他：“你就是太胆小！找个机会制造意外，神不知鬼不觉地解决他！”刘贵无奈之下，只好点头答应。
就在孙霸和刘贵谋划着如何除掉林羽时，包拯巡查到此地。包拯以公正廉明、断案如神著称，所到之处，冤假错案无所遁形，百姓们对他敬仰有加。林羽听闻这个消息后，心中燃起了希望之火。他深知这或许是自己唯一的翻案机会，于是在其他囚犯和狱卒的帮助下，偷偷写了一封血书，申诉自己的冤屈，详细描述了被孙霸和刘贵诬陷的经过，并附上了自己对案件破绽的分析，托一位即将出狱的囚犯带出监狱，辗转交到包拯手中。
包拯收到血书后，立刻察觉到这起案件疑点重重。他一向对冤假错案深恶痛绝，决定亲自提审林羽。当包拯来到监狱时，整个监狱都轰动了。囚犯们纷纷围拢过来，为林羽求情，诉说他在狱中治病救人的善举。包拯看着眼前这个虽面容憔悴但眼神坚定的年轻人，心中暗暗赞许。
林羽被带到包拯面前，他不卑不亢，将自己的遭遇一五一十地详细道来，从穿越到北宋的经历，到在集市上做生意被孙霸盯上，再到被诬陷入狱遭受酷刑。他条理清晰地指出案件中的诸多漏洞，比如所谓的盗窃官银现场没有他的任何指纹和脚印，证人也是孙霸花钱收买的地痞无赖，毫无可信度。包拯一边仔细倾听，一边不时提问，林羽对答如流，凭借自己对宋朝律法的了解和现代的逻辑思维，让包拯更加确信这是一起冤案。
包拯随后展开深入调查，他派得力手下暗中收集孙霸和刘贵的犯罪证据。经过一番艰苦的侦查，终于掌握了他们贪污受贿、欺压百姓、伪造证据等一系列罪行。在铁证面前，孙霸和刘贵再也无法抵赖。包拯依法判处他们应有的刑罚，孙霸被打入大牢，刘贵被革职查办。林羽的冤屈终于得以洗刷，他重获自由。
出狱后的林羽并没有被仇恨冲昏头脑，他深知自己势单力薄，要想在这个世界立足并彻底铲除像孙霸背后那样的恶势力，必须积蓄力量。他决定凭借自己的医术在汴京开一家医馆。起初，百姓们对这个年轻的大夫心存疑虑，毕竟医馆在汴京并不少见，且大多是有多年行医经验的老大夫坐诊。但林羽并不气馁，他张贴告示，承诺免费为前五十位患者诊治。
很快，医馆迎来了第一位患者，是一位腿部溃烂、久治不愈的老人。林羽仔细检查了老人的伤口，发现是因为伤口感染后处理不当，导致病菌深入骨髓。他运用现代医学的清创技术，小心翼翼地清除腐肉和脓液，又按照《济世医典》中的药方，配制了具有活血化瘀、清热解毒功效的草药膏，敷在伤口上，同时让老人内服调理气血的汤药。在林羽的悉心治疗下，老人的伤口逐渐愈合，病情一天天好转。
此事很快在汴京传开，越来越多的患者慕名而来。有个孩子患上了怪病，整日昏迷不醒，多方求医无果。林羽经过仔细诊断，结合现代医学的神经系统知识和中医的经络理论，判断是孩子脑部经络受阻。他采用针灸疗法，选取特殊穴位施针，同时配合服用醒脑开窍的中药。经过几天的治疗，孩子终于苏醒过来，家长对林羽感激涕零，送来了写有“妙手回春”的锦旗。
林羽的医馆名声越来越大，前来求诊的患者络绎不绝，从普通百姓到商贾大户，都对他的医术赞不绝口。他不仅治病救人，还经常免费为穷苦百姓提供药物和治疗，在汴京百姓心中树立起了极高的威望。与此同时，林羽在与患者的接触中，也开始暗中打听孙霸背后恶势力的线索，他知道，自己的复仇之路才刚刚开始，而医术将成为他最有力的武启，帮助他一步步走向那些隐藏在黑暗中的敌人 。
